上海港与宁波港是长三角地区最为瞩目的两大港口。为加快推进上海为中心，江苏、浙江为两翼的上海国际航运中心建设，实现优势互补和共同发展，双方早在2007年就开始启动了合作共赢的“四大机制”，近几年，双方形成了良好的竞合关系。
中投顾问流通行业研究员黎雪荣认为，长江三角洲地区是目前全国经济和贸易发展最为强劲的地区之一，上海、江苏、浙江三省市的各港口组成了具有强大发展潜力的长江三角洲港口群。宁波港和上海港各有优劣势，都是国际航运中心的组成部分，双方的合作能够起到优势互补的作用，进一步推动上海国际航运中心的建设。
相比上海港，宁波港的最大优势就是其深水港优势，它是中国大陆大型和特大型深水泊位最多的港口。随着现代港口船舶大型化和集装箱化的发展，这种优势越来越显现出来。2009年，全球超大型巨轮挂靠宁波港口数量增长明显。2009年，载箱量1万标准箱以上的集装箱船进出港口369艘次，比2008年增长近一倍；20万吨级以上超大型矿轮进出港口926艘次，同比增长47.9%；30万吨级油轮为579艘次，增长82.6%。
相比宁波港，上海港港口条件相对不利，但对比宁波港港口腹地少的缺陷，其最大的优势就是区位优势和腹地优势。上海港通过长江“黄金水道”可将其经济腹地扩展到涵盖江、浙、皖、赣、鄂、湘、川诸省，包括秦岭和黄河以南的陕西汉中、河南大部及鲁西南的长江流域广大地区。上海与长江流域腹地之间的双向联系及互补互动，成为上海港口和经济发展的强大基础。
黎雪荣指出，虽然宁波港与上海港在货源方面有一定的竞争，但是从长远来看，长江三角洲港口群的合作显得更为重要，共同把国际航运中心建设好，能够极大地增强我国港口群的国际竞争力。随着上海国际航运中心的建立，今后两港口将会进一步加强信息沟通，在业务上的互助互动，以及开展技术和管理等层面的合作。
中投顾问最新发布的《2010-2015年长三角地区港口业投资分析及前景预测报告》显示，2009年上海港货物吞吐量达到5.9亿吨，继续保持全球第一；国际标准集装箱吞吐量达到2500.2万标箱，继续名列全球第二。2009年宁波港口货物吞吐量达到3.84亿吨，继续保持大陆沿海港口第二位；完成集装箱吞吐量1042.3万标箱，居大陆沿海港口第四位。
